Prečo nebudeme niekoľko týždňov vedieť, aký smrteľný je Omicron. Laboratórne testy a vzorce šírenia ukážu, či mnohé mutácie nového variantu SARS-CoV-2 sú vážnou hrozbou. 24. novembra o 7:30 Kristian Andersen, výskumník infekčných chorôb v Scripps Research, dostal okamžitú správu na Slacku: „Tento variant je úplne šialený.“
Aký nebezpečný je mutant Omikron, súbor nových sekvencií genómu SARS-CoV-2
Slovenskí antivaxeri falošnej pandémie Omicron si zase prídu na svoje. Piják im skončil s Covidom v nemocnici, mesík sa radšej skrýva, keď sa zistilo, že Ivermektín je podvod a funguje len pri parazitoch. Hlupák neonacistický Uhrík skončil s Covidom, ale kľudne propaguje knihu Falošná pandémia atd, atd. Tento zoznam klamárov, ktorí dostali Covid-19 sa bude čím ďalej iba zväčšovať. My si počkáme.
Pekné zhrnutie Ivermektín klamstva nájdete v článku – Ivermektín v Indii, Uttarpradéš, žiadne dôkazy o užitočnosti lieku
Molekulárny evolučný biológ Andrew Rambaut z University of Edinburgh reagoval na súbor nových sekvencií genómu SARS-CoV-2 zdieľaných na globálnej platforme GISAID. Tri pochádzajú zo vzoriek zozbieraných v Botswane 11. novembra, ktoré tam sekvenovali výskumníci; jeden bol vyzdvihnutý o týždeň neskôr cestovateľom z Južnej Afriky do Hongkongu.
Andersen sa pozrel na údaje a potom odpovedal: „Len som sa pozrel na zoznam mutácií, tak šialené.“
Hovorili o tom že nový variant záujmu, a dlhá vetva, ktorú si Andersen všimol, odkazuje na jej vzdialenosť ku každému inému známemu vírusu na evolučnom strome SARS-CoV-2. Zdá sa, že variant zachytil desiatky mutácií, o mnohých z nich je známe, že sú dôležité pri vyhýbaní sa imunite alebo zvyšovaní prenosnosti, pričom v databáze miliónov vírusových genómov nie sú žiadne prechodné sekvencie.
Tom Peacock, virológ z Imperial College London, 23. novembra, po tom, čo si v databáze GISAID všimol zvláštne sekvencie, už zverejnil svoj vlastný verdikt na GitHub: „To by mohlo byť skutočne znepokojujúce.“
Teraz svet opäť sleduje, ako výskumníci pracujú po nociach a víkendoch, aby zistili, čo nový variant má pre ľudstvo pripravené. Je infekčnejší? Smrteľnejší? Je to lepšie pri reinfekcii uzdravených ľudí? Ako dobre sa vyhýba imunite vyvolanej vakcínou? A odkiaľ to prišlo? Zistenie si vyžaduje čas, varuje Jeremy Farrar, šéf Wellcome Trust: „Obávam sa, že trpezlivosť je rozhodujúca.“
Tomuto novému variantu už boli na stope aj výskumníci v Južnej Afrike. Niekoľko tímov sa nezávisle snažilo zistiť, prečo prípady stúpajú v Gauteng, severnej provincii, ktorá zahŕňa Johannesburg a Pretóriu. A súkromné laboratórium s názvom Lancet Laboratories si všimlo, že rutinné testy polymerázovej reťazovej reakcie (PCR) na SARS-CoV-2 nedokázali v mnohých vzorkách odhaliť kľúčový cieľ, gén S , čo je fenomén, ktorý sa predtým vyskytoval u Alpha, ďalšieho variantu vírusu. obavy.
Keď Lancet sekvenoval osem z týchto vírusov, zistil prečo: Genóm bol tak silne zmutovaný, že v teste chýbal gén.
Lancet zdieľal genómy so sieťou pre dohľad nad genomikou v Južnej Afrike, ktorá zvolala naliehavé stretnutie na 23. novembra. “Boli sme šokovaní počtom mutácií,” hovorí Tulio de Oliveira, virológ z University of KwaZulu-Natal a hlavný výskumník NGS-SA. Po stretnutí, hovorí de Oliveira, zavolal generálnemu riaditeľovi zdravotníctva Juhoafrickej republiky a „požiadal ho, aby informoval ministra a prezidenta, že sa objavuje potenciálny nový variant“.
Tím sekvenoval ďalších 100 náhodne vybraných sekvencií z Gauteng v nasledujúcich 24 hodinách. Všetky ukázali ten istý vzorec. Po informovaní vlády de Oliveira a jeho kolegovia predložili svoje dôkazy na tlačovej konferencii ráno 25. novembra. Dňa 26. novembra WHO označila vírus za „variant záujmu“.
Jedným z dôvodov obáv je, že sekvenované vzorky naznačujú, že rýchlo nahradil iné varianty v Južnej Afrike. Ale ten obraz môže byť skreslený. Po prvé, sekvenovanie sa mohlo zamerať na možné prípady nového variantu v posledných dňoch, čo by mohlo spôsobiť, že sa bude javiť častejšie, ako je.
Údaje PCR poskytujú širšie pokrytie a menej zaujatý pohľad, ale aj tam vzorky so zlyhaním génu S naznačujú rýchly nárast
